El portal Biblioteca de Menéndez Pelayo ofrece una selección de la extensa colección de libros y estudios de humanidades que don Marcelino reunió a lo largo de su vida. En 1906 decía que era la «única obra mía de la cual estoy medianamente satisfecho».

En esta web sobresale especialmente el Fondo de teatro antiguo español, con varios millares de títulos, impresos o manuscritos, de los dramaturgos del Siglo de Oro, además de varios catálogos de impresos teatrales, estudios y una selecta bibliografía sobre teatro clásico español.

El testamento de Menéndez Pelayo recoge las condiciones con las que la biblioteca se legaba a Santander, su ciudad natal, para asegurar su conservación íntegra y puesta al servicio de la investigación.